1546 (MDXLVI, na numeração romana) foi um ano comum do século XVI do Calendário Juliano, da Era de Cristo, a sua letra dominical foi C (52 semanas), teve início a uma sexta-feira e terminou também a uma sexta-feira.
1 de Abril - Criação da Vila da Praia na ilha Graciosa, Açores.
2 de Abril - Elevação da Vila de Ponta Delgada, ilha de São Miguel, Açores à categoria de cidade.
10 de Janeiro - Erhard Cell, historiador e filólogo alemão (m. 1606).
19 de Janeiro - Heinrich Keppler, pai do astrônomo alemão Johannes Kepler (1571-1630) (m. 1590).
27 de Janeiro - Joachim Friedrich, Eleitor de Brandenburgo, (m. 1608).
03 de Fevereiro - Friedrich I, Conde de Salm, (m. 1608).
04 de Fevereiro - Iacobus Monavius, Jakob Monau, jurista, filólogo e reformador alemão (m. 1603).
11 de Fevereiro - Philipp Eduard Fugger, Barão de Kirchberg e Weissenhorn (m. 1618).
14 de Fevereiro - Johannes Pistorius, O Jovem, médico, historiador e teólogo alemão (m. 1608).
28 de Fevereiro - Cristina, Princesa de Holstein-Gottorp, (m. 1618).
14 de Março - Johann Freymonius, Johann Wolfgang Freymon von Randeck, jurista e político alemão (m. 1610).
20 de Março - Baha ad-Din Muhammad ibn Husayn al-Amili, também conhecido como Shaykh Baha'i, teólogo, matemático e astrônomo iraniano de origem síria (m. 1622).
21 de Março - Bartholomäus Spranger, pintor e aquafortista flamengo (m. 1611).
27 de Março - Johannes Piscator, teólogo, reformador e professor universitário alemão (m. 1625).
29 de Março - Anne d'Escars de Givry, cardeal francês (m. 1612).
12 de Abril - Eva, Condessa de Castell, (m. 1570).
21 de Abril - Arcangelo Crivelli, filósofo, historiador e político italiano (m. 1617).