Michiel Jonckheere, né le 3 janvier 1990 à Ostende en Belgique, est un footballeur et entraîneur belge qui joue au poste de milieu de terrain.
Le 27 mai 2025, il succède à Bernd Storck comme entraîneur principal du KV Courtrai.
Michiel Jonckheere est le cousin de Jelle Bataille, également footballeur professionnel.
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