Margherita Zalaffi est une épéiste et fleurettiste italienne née le 7 avril 1966 à Sienne.
L'escrimeuse italienne participe à l'épreuve de fleuret par équipe lors des Jeux olympiques d'été de 1988 à Séoul et remporte la médaille d'argent olympique avec ses coéquipières Annapia Gandolfi, Lucia Traversa, Dorina Vaccaroni et Francesca Bortolozzi-Borella. Aux Jeux olympiques d'été de 1992 à Barcelone, elle décroche la médaille d'or de fleuret par équipe avec Giovanna Trillini, Diana Bianchedi, Francesca Bortolozzi-Borella et Dorina Vaccaroni, et se classe cinquième de l'épreuve de fleuret individuelle. Elle concourt aux Jeux olympiques d'été de 1996 à Atlanta ; elle est médaillée d'argent olympique dans l'épreuve d'épée par équipe avec Laura Chiesa et Elisa Uga et se classe quatrième de l'épreuve individuelle d'épée.
Médaille d'or au tournoi d'escrime de Marseille 1992
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