Heyneke Meyer, né le 6 octobre 1967 à Nelspruit, est un entraîneur sud-africain de rugby à XV. Il entraîne les Blue Bulls entre 2002 et 2007 menant cette équipe à la victoire à quatre reprises en Currie Cup. Il est également vainqueur du Super 14 avec les Bulls en 2007. Il signe en juin 2008 dans le club des Leicester Tigers.
Il est le sélectionneur de l'équipe d'Afrique du Sud de janvier 2012 à décembre 2015.
Il fait des études de psychologie sportive à l'Université de Pretoria, puis il commence à entraîner des petits clubs. Il rejoint les Eagles comme entraîneur adjoint en 1997. L'année suivante, il est l'entraîneur principal de l'équipe qu'il mène à la septième place de la Currie Cup avant d'atteindre les demi-finales la saison suivante.
En 2000, il rejoint les Northern Bulls.
En 2002, c'est l'entraîneur principal des Blue Bulls, il remporte quatre trophées de la Currie Cup, il est même le premier entraîneur d'une équipe sud-africaine à remporter le Super 14 avec les Bulls en 2007.
Heyneke Meyer signe l'été 2008 au club anglais des Leicester Tigers pour remplacer Marcelo Loffreda.
En 2018, il devient directeur sportif du Stade français Paris. Le 12 novembre 2019, le club est dernier du championnat après 9 journées. Il présente alors sa démission au président avec effet immédiat.
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