Andrea Cesalpino (Andreas Caesalpinus en latin ; André Césalpin en français), né le 6 juin 1519 ou, plus probablement, en automne 1524 à Arezzo en Toscane et mort le 23 février 1603 à Rome, est un philosophe, médecin, naturaliste et botaniste italien.
Il est connu pour avoir décrit une circulation sanguine générale, plus de 50 ans avant celle de William Harvey.
Selon les biographes Andrea Cesalpino serait né d'un père médecin ou maçon. Son nom proviendrait de l'origine de sa famille issue de la Gaule cisalpine.
En 1544, il commence ses études de médecine à l'université de Pise. Il a pour maîtres Realdo Colombo en médecine et Luca Ghini pour la botanique. Il apprend la philosophie auprès de Simone Porzio, et il assiste aux démonstrations anatomiques de Vésale.
Reçu docteur en 1551, il enseigne la philosophie, la médecine et la botanique dans cette même université de Pise. Il contribue à la description de très nombreuses plantes en Italie. Il succède à Ghini à la tête du jardin botanique de Pise en 1554, fonction qu'il occupe jusqu'en 1558.
En 1593, il est appelé à Rome pour enseigner la médecine et être le médecin personnel du pape Clément VIII qui le nomme professeur de médecine au collège de la Sapience
Il meurt à Rome, à l'âge de 78 ans.
Comme philosophe, il se fait remarquer par sa connaissance profonde des écrits d'Aristote. Ses travaux publiés restent sous l'influence d'Averroès et il y fait montre d'un certain panthéisme.
Son œuvre philosophique la plus importante est Quaestionum peripateticarum libri quinque, paru à Florence en 1571, où il étudie la pensée d'Aristote et embrasse la doctrine des averroïstes.
Le problème métaphysique dominant de l'époque était les rapports entre la foi et la raison, aussi bien pour les catholiques que pour les protestants. Selon Cesalpino, Aristote ne sait rien sur la Création donc, dans une conception aristotélicienne, Dieu n'est pas une cause efficiente ou motrice du monde, mais sa cause formelle qui organise toutes ses réalités (fond, substance, changements et devenir de toutes choses).
Dans cette interprétation d'Aristote par Cesalpino, la Nature est une, et explicable par la doctrine de la forme et de la matière. Cesalpino pose le problème de la double vérité : là où Aristote est contraire à la Révélation, il doit y avoir une erreur dans son raisonnement. Cesalpino affirme que son but est d'expliquer Aristote, les théologiens devant s'occuper aussi de découvrir ses erreurs.
Cette approche le fait accuser de panthéisme et même d'athéisme. Cependant, il est resté catholique toute sa vie.
Les doctrines philosophiques de Cesalpino sont combattues par Samuel Parker, archevêque de Cantorbéry, et par Nicolaus Taurellus (de), médecin de Montbéliard, auteur de l'essai critique Caesae Alpes (1597), qui le dénoncent à l'Inquisition. Cesalpino y échappe, en restant protégé par le pape Clément VIII.
Taurellus reconnait plusieurs points soulevés par Cesalpino, mais il s'oppose à lui en faisant du dieu d'Aristote, non pas un Deus rotator comme Cesalpino, mais un actus purus conforme à la doctrine chrétienne. Taurellus conclut qu'Aristote doit être étudié dans les écoles, mais seulement dans la mesure où il s'accorde avec la Révélation, et non pas là où il la contredit.
Ces discussions ont beaucoup d'influence dans les universités allemandes (nouvellement créées après les universités italiennes). La logique et philosophie naturelle d'Aristote entrent dans les universités allemandes par le biais des facultés de médecine.
Accusé de panthéisme, Cesalpino sera par la suite critiqué comme précurseur de Spinoza.
En médecine, à la suite de son maître Realdo Colombo, il aurait été le premier à reconnaître la circulation du sang, avant William Harvey selon des médecins historiens italiens. Ceux-ci s'appuient sur le témoignage de Giovanni Nardi (it) (mort en 1655) qui, bien que lié d'amitié avec Harvey, voyait en Césalpino le véritable découvreur.
Les historiens modernes s'accordent sur le fait que Cesalpino est bien le premier à utiliser le terme de circulatio en 1569 pour décrire une circulation sanguine générale.