L'année 1898 est une année commune qui commence un samedi.
20-25 janvier, Algérie : émeutes anti-juives, en particulier à Alger. Elles ne prennent fin qu’après le départ du gouverneur général Louis Lépine en juillet.
Février : révolte de Bai Bureh contre l’impôt de case et les « créoles » en Sierra Leone.
17 mars : le syrien sunnite Rashid Rida fonde en Égypte la revue politique et littéraire al-Manar (Le Phare), qui dans la lignée de la Salafiyyah, plaide pour un relèvement de la société arabe par les valeurs de l’Islam. Il propose l’établissement d’un Califat à La Mecque.
8 avril, Soudan : victoire anglo-égyptienne sur les Mahdistes à la bataille d’Atbara.
27 avril : début de la révolte des Temnés et Mendés contre l’impôt sur les cases en Sierra Leone.
1er mai : les Français prennent Sikasso qui est mise à sac.
14 juin : convention franco-britannique signée à Paris fixant les limites des possessions françaises en Côte d’Ivoire, au Soudan et au Dahomey et les colonies britanniques de Côte-de-l’Or, et au Nigeria britannique (ligne Say-Barroua). La convention reconnait les droits de la France sur le Tchad.
10 juillet : début de l'affaire de Fachoda, tensions franco-britanniques sur le Soudan (juillet-novembre). Les Français de la mission Marchand arrivent à Fachoda sur le Nil Blanc. L’expédition française illustre les méthodes de colonisations qui prévalent au Soudan central : cette unité d’une centaine d’homme vivant sur le pays est destinée non pas à réaliser l’occupation effective, mais à installer un réseau de petites garnisons capables de garantir les territoires de la convoitise britanniques.
La crise de Fachoda renforce l’antagonisme franco-britannique en Égypte. La France entrave l’action de Londres en faisant passer sous sa protection consulaire de nombreux responsables nationalistes par le système des capitulations.
19 juillet : échec de la révolte de l’ethnie des Héhé, dirigée par le chef Mkwawa contre la « pacification » allemande (Zambie). Mkwawa bat à deux reprises les colons, mais ceux-ci finissent par prendre la capitale Kalenga en 1894 et Mkwawa se suicide avant d'être pris le 19 juillet 1898. Dans la région de Bagamoyo, les soulèvements de Gogo et des Chaga sont réprimés de la même façon par les troupes allemandes.
22 juillet : Djibouti devient une colonie française et prend le nom de « Côte française des Somalis ».
26 juillet : Édouard Laferrière est nommé gouverneur général de l’Algérie (fin en 1900).
25 août : Laferrière obtient du gouvernement français les décrets qui sont en quelque sorte une Constitution de l’Algérie : création des délégations financières, réorganisation du Conseil supérieur, accroissement de l’autonomie économique et sociale.
2 septembre, Soudan : Kitchener écrase les Ansar (les soldats du Mahdi ou derviches) à la bataille d’Omdurman. Il occupe Khartoum et fait disperser les cendres du Mahdi dans le Nil. Kitchener est nommé lord of Khartoum. Tandis que son adjoint Wingate se lance à la poursuite du calife qui est tué au cours d’une bataille au Kordofan (Umm Diwaykarat, 24 novembre 1899), Kitchener remonte le Nil jusqu’à Fachoda.
19 septembre : Lord Kitchener arrive avec 3 200 hommes devant Fachoda. Marchand refuse d’évacuer la ville. Londres et Paris échangent des ultimatums. Une guerre entre la France et la Grande-Bretagne est envisagée, puis le gouvernement français s’incline.
29 septembre : difficile victoire des troupes françaises contre Samory Touré, finalement fait prisonnier par le capitaine Gouraud à Guélémou au Liberia. Il mourra en exil au Gabon (2 juin 1900). Sa défaite met fin à treize ans de luttes contre la France. Tout le Soudan occidental passe sous contrôle français excepté le Nigeria aux mains des Britanniques.
Octobre : Rabah ravage à nouveau le Baguirmi.