L'année 1688 est une année bissextile qui commence un jeudi.
14 janvier (4 janvier du calendrier julien) : William Dampier jette l’ancre sur la côte ouest de l’Australie (Nouvelle-Hollande). Dans l’espoir de trouver de l’eau potable, il envoie deux hommes, armés de mousquets, s’emparer de deux Aborigènes, qu’il décrit comme les « êtres les plus misérables au monde ».
5 février : les jésuites s'installent à Pondichéry.
7 février : arrivée à Pékin des jésuites français Jean-François Gerbillon, Jean de Fontaney, Joachim Bouvet, Louis Le Comte et Claude de Visdelou. Ils sont reçus le 21 mars par l'empereur Kangxi, qui retient Gerbillon et Bouvet.
Mars : l'explorateur anglais William Dampier visite l'Île Christmas.
13 avril, baie de Saldagne : arrivée des premiers huguenots en Afrique du Sud. Après la révocation de l'édit de Nantes, 175 huguenots français rejoignent les Boers et fondent Franschhoek. La colonie Boer du Cap est alors inférieure à 1 000 personnes. Environ 400 huguenots français viendront la renforcer. Malgaches, Indiens et Malais sont déportés vers l’Afrique du Sud.
18 avril : pétition de Germantown. Les Quakers de Pennsylvanie s'opposent à l'esclavage.
18 mai, Louvo : coup d'État d'Opra Pitracha (Phetracha) ; le ministre Constantin Phaulkon et ses partisans sont emprisonnés. Phaulkon est exécuté le 5 juin. Phetracha s'empare du trône d'Ayutthaya (Siam) à la mort du roi Narai le 11 juillet ; les Français sont expulsés du pays le 22 novembre.
6 juin - 2 novembre : siège de la forteresse française de Bangkok par les troupes siamoises de Pitracha.
1er - 16 juillet : l’amiral d'Estrée bombarde Alger.
14 juillet : en Inde, répression par les Moghols de la révolte des Jats de Rajaram, qui est tué.
28 août : victoire du khan des Dzourgars sur les Khalkhas et conquête de la Mongolie (1688-1690). Galdan, à la tête de 30 000 hommes, marche contre le Touchetou-khan et l’écrase dans la région du lac Ologhoï. Les Khalkhas doivent se réfugier au sud et implorer le secours des Mandchous. L’empereur Kangxi refuse de prendre parti.
30 août : François Martin, le gouverneur de Pondichéry, missionne son gendre André Bourreau-Deslandes, sur ordre de la Compagnie française des Indes orientales, pour fonder des comptoirs au Bengale, notamment celui de Chandernagor.
10 décembre : arrestation de William Penn, ami de Jacques II d'Angleterre, par les révolutionnaires anglais.
Canada : Jacques de Noyon parvient jusqu’au lac à la Pluie et lie des relations commerciales préliminaires avec les Assiniboines.
18 janvier, Hongrie : reddition de Munkács. Ilona Zrínyi, épouse d’Imre Thököly alors en captivité chez les Turcs, est emmenée à Vienne avec ses enfants après la chute de son château de Munkács après trois ans de siège. Son fils Ferenc II Rakóczi est séparé de sa mère et élevé chez les jésuites sous la surveillance de son tuteur l’archevêque Léopold Kollonich.
Traité d’Hermannstadt. La Transylvanie devient un protectorat autrichien.
Frédéric III devient électeur de Brandebourg (fin en 1713).