L'année 1589 est une année commune qui commence un dimanche.
5-15 mars : la flotte portugaise met Mombasa à sac. Le corsaire turc Amir Ali Bey prend la fuite. Les Portugais rétablissent leur souveraineté sur la côte swahilie.
Zimbabwe : Gatsi Rusere (ou Gasse Lucere) succède au monomotapa Nogomo.
Éthiopie : une force turque, aidée par un chef tigréen, reprend Débaroa, mais est délogée. Le négus Malak-Sagad, pour expulser définitivement les Ottomans, assiège leur dernière base, le port d’Arkiko. Il ne parvient pas à le prendre, mais le Pacha demande la paix et lui envoie de nombreux présents, parmi lesquels un cheval sellé et harnaché d’or.
Naissance de Yontan Gyamtso, quatrième dalaï-lama du Tibet (fin en 1617). À la mort de Sonam Gyatso sur le chemin du retour au Tibet (1588), le quatrième dalaï-lama est trouvé dans la famille proche d’Altan Khan.
Début de la construction du château de Hiroshima par le seigneur Terumoto Mori.
Inde : fondation de Hyderabad dans le Deccan sur un plan en croix par le sultan de Golconde.
17 janvier : fondation du patriarcat de Moscou. Boris Godounov émancipe l’Église russe de la tutelle de Constantinople en créant le patriarcat de Moscou. Quatre métropoles sont érigées : Novgorod, Kazan, Rostov-sur-le-Don, Kroutitza.
23 janvier : le tsar Fédor Ier désigne Job comme patriarche de Moscou.
26 janvier : le patriarche de Constantinople, Jérémie, en visite à Moscou, procède à l'ordination du métropolite Job au rang de « patriarche de toute la Russie ».
15 avril : départ de Plymouth de l'expédition Drake-Norreys (fin le 3 juillet). Échec d'une flotte anglaise commandée par John Norris et Francis Drake contre l'Espagne et le Portugal.
4-19 mai : Francis Drake attaque La Corogne.
30 avril : Ferdinand Ier de Médicis, grand-duc de Toscane, renonce au titre de cardinal pour épouser Christine de Lorraine.
8-9 juin : échec de John Norris devant Lisbonne.
19-21 juin : Francis Drake met Vigo à sac.
23 juillet, France : émeutes dans la ville du Puy et début dans le Velay des troubles et combats entre la Ligue et les Royalistes, qui détruiront totalement les bourgs d'Espaly et Saint-Marcel, et ne cesseront réellement qu'en 1596.
27 juillet, Pologne-Lituanie : Michał Rahoza est nommé métropolite de Kiev par le roi Sigismond III, ordonné début août par le patriarche de Constantinople Jérémie II lors d'un synode réunit à Brest. L’Église ruthène est désorganisée. Jérémie II rend visite sans succès au métropolite de Nowogrodek.
1er août : Henri III de France est assassiné par Jacques Clément. Henri IV devient roi de France. Début de la dynastie des Bourbons, et des combats entre la Ligue catholique et les royalistes inconditionnels.