María Magdalena de Habsburgo y Wittelsbach (Graz, 7 de octubre de 1589-Padua, 1 de noviembre de 1631) fue la esposa de Cosme II de Médici, gran duque de Toscana.
Era hija de Carlos II de Estiria, archiduque de Austria, y de María Ana de Baviera. El matrimonio con el gran duque tuvo lugar en 1608. Después de la prematura muerte de su marido, acaecida en 1621, se dedicó junto a su suegra, Cristina de Lorena, a la educación de sus hijos, en particular del futuro gran duque Fernando II. Obtuvo además como herencia el gobierno de la ciudad de San Miniato hasta su muerte y no paró hasta que la pequeña ciudad se convirtió en diócesis.
Se interesó por la ciencia y procuró a sus hijos una gran educación, eligiendo como preceptores a algunos científicos discípulos de Galileo Galilei.
Acton, Harold: The Last Medici, Macmillan, London, 1980, ISBN 0-333-29315-0
Strathern, Paul: The Medici: Godfathers of the Renaissance, Vintage books, London, 2003, ISBN 978-0-09-952297-3
Hale, J.R.: Florence and the Medici, Orion books, London, 1977, ISBN 1-84212-456-0
Constantin Wurzbach, Biographisches Lexikon des Kaisertums Österreich, Vienna, 1861, Vol. VII, pp. 56-58 (versión en línea)