José María Fagoaga Liyzaur (Rentería, 1764 - Ciudad de México, 27 de enero de 1837) fue un insurgente vasco que participó en las luchas de México por independizarse de España.
Fue hijo de Juan Bautista Fagoaga y Arozqueta y de María Manuela de Liyzaur y Aguirre.
Después de la invasión napoleónica en España, en 1808 José María y sus primos José Francisco Fagoaga Villaurrutia (segundo marqués del apartado) y Francisco Fagoaga Villaurrutia, «apoyaron la idea de que la Nueva España debía desligarse de una monarquía incierta».
En 1813 José María fue acusado por el virrey Félix María Calleja por mantener correspondencia con los insurgentes, por lo cual en 1815 fue enviado a prisión, y posteriormente fue desterrado a España; volvió en 1820 y fue uno de los notables que firmaron el acta de Independencia de México. Formó parte de la Junta Provisional Gubernativa, y fue uno de los fundadores de la masonería en México. No tardó en ser puesto nuevamente en prisión acusado de conspirar en contra del emperador Agustín de Iturbide, más adelante fue expulsado del país a causa de su origen español, pero consiguió volver una vez más y desempeñó importantes cargos hasta su muerte.
Hijo de criollos y nacido en el país vasco, José María pertenecía a una de las familias más ricas y poderosas de la aristocracia novohispana, cuya influencia se debió principalmente a las inversiones en minas, tiendas, y la banca.
A los 8 años de edad fue trasladado a la Ciudad de México, en donde realizó su educación y carrera literaria, estudió en el Colegio de San Juan de Letrán y de San Ildelfonso. Se examinó de Abogado en la Real Audiencia y fue examinador del Ilustre Colegio de Abogados. Desde muy joven estuvo en contacto con las ideas liberales desarrolladas en Inglaterra, lo que le llevó a interesarse por la política. Asistía a reuniones y tertulias y fue regidor del Ayuntamiento de México. Además de pertenecer a la logia Escocesa.
José María contrajo matrimonio el 17 de mayo de 1801 con su prima hermana Josefa María Fagoaga Villaurrutia, hija de Francisco Cayetano Manuel de Fagoaga de Arozqueta, también conocido como el primer marqués del Apartado. Fue padre de Josefa Juana de Bautista de Fagoaga y Fagoaga; Elena Fagoaga y Fagoaga, María de la Merced Lina Josefa Fagoaga y Fagoaga; María Dolores Julia Josefa Fagoaga y Fagoaga. La primera y la última no tuvieron descendencia
La familia Fagoaga en la Nueva España
La familia Fagoaga tuvo su inicio con la llegada del inmigrante Vasco Francisco de Fagoaga Iragorry (1679-1736) originario de Oyarzun; se dedicó al oficio de apartador de la Casa de Moneda, y era tal su destreza que se convirtió en un gran perito en la materia llegando a redactar 2 libros al respecto.
La familia Fagoaga, una de las más ricas del México colonial, a fines del siglo XVIII y principios del XIX, tuvo un muy interesante, aunque poco conocido papel en la lucha por la Independencia no sólo de México, sino de toda Latinoamérica. Sabemos que algunos miembros de esta familia estuvieron en la capital del Imperio Británico a partir de 1809 y ahí se involucraron con el movimiento independentista del Precursor Francisco de Miranda y de la Logia Lautaro, asimismo estaban involucrados miembros de esta familia en movimientos dentro de la Nueva España a favor de la Independencia.
Francisco de Fagoaga contrajo nupcias con la dama criolla Josefa de Arozqueta, hija de Juan Bautista de Arozqueta, quien tenía interés en el negocio de importación y exportación, además de ser poseedor de minas y haciendas alrededor de Zacatecas. A partir de ese momento se inició la tradición de los Fagoaga de casarse sólo entre familias poderosas.
De los hijos de Francisco Fagoaga el más conocido es Francisco Cayetano Manuel Fagoaga y Arozqueta (1724-1799), quien fue el “apartador de oro y plata” desde 1718 hasta 1778, el rey de España, Carlos III le otorgó el título de marqués del Apartado en 1772. Junto a su hermano Juan Bautista Fagoaga y Arozqueta (1727-1804), heredaron el éxito de su padre en los negocios. Otros hijos fueron José Joaquín Felipe Fagoaga y Arozqueta (1720-1776); Agustina María, Ana Javiera y Juana María.
En la última década del siglo XVIII se dio un auge espectacular en la mina de Pabellón, en Sombrerete, Zacatecas misma que convirtió a los hermanos Fagoaga en los particulares más ricos de México. Consolidándose con una de las familias más importantes de la minería novohispana.
El Primer marqués del Apartado se casó en 1772 con María Magdalena Villaurrutia. Sus hijos fueron María Josefa Fagoaga Villaurrutia (1772), Josefa María Fagoaga Villaurrutia (1775), José Francisco Fagoaga Villaurrutia (1783) nombrado Segundo marqués del Apartado, y por último a Francisco Fagoaga Villaurrutia (1788).
Juan Bautista Fagoaga se casó con María Manuela Leyzaur. Teniendo como hijos a José Mariano Fagoaga Leyzaur quien sería el administrador general del Tribunal Minero, José Juan Fagoaga Leyzaurs quien ocuparía el cargo de alcalde del Ayuntamiento de México; Manuela Fagoaga Leyzaur, Josefa Jacinta Fagoaga Leyzaur, Josefa Ramona Fagoaga Leyzaur y José María Fagoaga Leyzaur.
José María Fagoaga y el autonomismo novohispano
En mayo de 1808 Napoleón Bonaparte hizo prisioneros a la familia real, dejando sin rey a las colonias americanas, a causa de esto nació la incertidumbre en las autoridades del virreinato novohispano en relación con seguir bajo el mandato de España; Los conservadores quería que se reconociera el poder de la Junta de Sevilla; Por otro lado casi todos los integrantes del Ayuntamiento de México sostenían que era necesaria la formación de una Junta Novohispana que gobernara hasta que Fernando VII asumiera el poder en la península.
Ente este hecho la familia Fagoaga dejó un poco de lado sus haciendas y minas para involucrarse en la vida política de la Colonia, dividiendo a la familia en 2 posturas en donde el primer Marqués del Apartado, José Mariano Fagoaga Leyzaur y José Juan Fagoaga Leyzaur fueron partidarios de obedecer a la Junta de Sevilla y ser fieles a la Corona. Mientras que José María Fagoaga Leyzaur y sus primos Francisco Fagoaga Villaurrutia y el segundo Marqués del Apartado apoyaban el establecimiento de la Junta Gobernativa durante la cautividad de Fernando VII.