José Joaquín Pérez Mascayano (Santiago, 6 de mayo de 1801-Santiago, 1 de junio de 1889) fue un abogado y político chileno que se convirtió en presidente de la República entre 1861 y 1871. Su candidatura como presidente surgió a raíz de la negativa de Antonio Varas de suceder al entonces presidente Manuel Montt. Previamente había sido parlamentario por la antigua provincia de Santiago, Curicó, Puchacay e Itata.
Nacido en Santiago en mayo de 1801, fue hijo de una familia aristocrática. Luego de cursar sus estudios, se inició tempranamente en la diplomacia. Fue nombrado secretario de la legación de Chile en Washington D. C. en 1826 y encargado de negocios en Francia en 1829. Al año siguiente, fue a Buenos Aires como representante diplomático.
Durante el gobierno conservador de Manuel Montt, pese a que desempeñó los cargos de senador y consejero de Estado, se mantuvo alejado de los conflictos políticos, lo que posibilitó su candidatura. El 18 de septiembre de 1861, asumió el cargo de presidente de Chile. Con sus 60 años, fue apoyado por los nacionales y por la Fusión Liberal-Conservadora, gobernando desde 1862 con este último conglomerado, dando inicio a un período de predominio liberal. A comienzos de su gobierno y como apuntaba su divisa, la primera acción relevante fue promover una «Ley de Amnistía» para el período 1851-1861, que fue aprobada con rapidez. En concordancia con el espíritu de tolerancia, existió durante su gobierno bastante libertad de prensa lo que permitió la publicación de sátiras de su persona y críticas al gobierno. En esta misma línea, sus contemporáneos recuerdan variadas anécdotas que muestran a Pérez en una faceta diferente y simpática, lo que fue apreciado por la ciudadanía, generando un mito popular al respecto.
Siendo presidente debió enfrentar diversos sucesos y reformas relevantes para la historia del país, como se refleja en sus discursos anuales. La ocupación de la Araucanía fue una de sus primeras acciones, proceso que continuó en los gobiernos siguientes, pero que durante su mandato ofreció la particularidad de iniciar con la proclamación del Rey de la Araucanía. En 1863, como presidente encabezó la ceremonia de inauguración del ferrocarril Valparaíso-Santiago y debió enfrentar el incendio de la iglesia de la Compañía de Jesús, suceso que entristeció a todo el país. Sin embargo, fue la Guerra contra España (1865-1866) el episodio más trágico y criticado de su gobierno. Pese al conflicto bélico, en estos años se llevaron a cabo relevantes medidas: se promulgó el Código del Comercio y la nueva Ley de aduanas. A su vez, se reinterpretó el artículo 5.º de la Constitución referente a la religión del país, promulgándose la Ley de la Libertad de Cultos (1865). En ese mismo año, se levantó un censo a nivel nacional que arrojó un total de 1 819 223 habitantes. En 1866, se estableció un tratado limítrofe con Bolivia que puso fin momentáneamente a las fricciones que enfrentaban a ambos países.
El 18 de septiembre de 1866, fue reelecto por un segundo quinquenio. El problema más grave que enfrentó durante estos años fueron las magras arcas fiscales, debido a las deudas que acarreó la guerra, las que obligaron a pedir un préstamo. La compra de buques y armamento, al igual que la fortificación de Valparaíso, se estimaron como una necesidad para proteger al país ante posibles ataques. Algunas reformas a la Constitución de 1833 fueron discutidas, pero solo una fue aprobada en agosto de 1871, cuando Federico Errazuriz Zañartu ya era presidente electo: la no reelegibilidad del presidente de la República. Después de entregar el poder al nuevo mandatario, siguió desempeñando importantes cargos políticos. Murió en 1889, a la avanzada edad de 89 años.
Nació en Santiago, el 6 de mayo de 1801. Hijo de Santiago Pérez Salas, exdiputado, y María de la Luz Mascayano y Larraín. Además luchó como soldado en la Batalla de Maipú a los 17 años, Fue nieto de José Antonio Pérez García, militar español, cronista e historiador.
Se casó con Tránsito Flórez y de la Cavareda el 9 de abril de 1840, con quien tuvo once hijos de los cuales solo cinco llegaron a la edad adulta.
Realizó sus estudios de humanidades en el Real Colegio Carolino, en el Instituto Nacional y completó su educación en la Real Universidad de San Felipe, donde se tituló de abogado.
Fue miembro del Partido Nacional o Monttvarista.
Se inició joven en la diplomacia y sirvió en la Secretaría de la Legación en Estados Unidos; en 1829 pasó a Francia como encargado de negocios. Durante el gobierno de José Joaquín Prieto Vial, se le encomendó la contratación de un empréstito en Londres. En 1830 fue enviado a misión a Buenos Aires, donde permaneció por varios años.
A su regreso, en 1844, fue nombrado ministro de Hacienda subrogante (s), cargo que ejerció desde el 12 de septiembre de 1844 hasta el 17 de abril de 1845, fecha en que fungió como interino en el mismo ministerio, hasta el 22 de septiembre de 1846. Luego fue nombrado ministro del Interior y Relaciones Exteriores, ejerciendo el cargo como tal entre el 12 de junio de 1849 y el 19 de abril de 1850; titularidad que desempeñó durante el gobierno de Manuel Bulnes.
Durante la administración del presidente Manuel Montt fue elegido senador y consejero de Estado.
Fue diputado propietario por la provincia de Aconcagua, en el Congreso Nacional Constituyente de 1826 entre el 4 de julio de 1826 y el 22 de junio de 1827. Se incorporó en la Sesión 196 en reemplazo de Martín Prats Urízar, quien renunció en la Sesión 180 luego de haber sido elegido intendente de Aconcagua.
Siete años más tarde, en 1837 fue electo diputado suplente por Santiago, por el período 1834-1837. Fue llamado a reemplazar al diputado propietario por esa provincia, Manuel Barros Andonaegui, quien murió a los pocos días de la apertura del periodo. No se incorporó hasta el 6 de junio de 1836.
En ese mismo año, fue electo diputado suplente por Itata, por el período 1837-1840. Inexplicablemente resultó electo vicepresidente de la Cámara de Diputados el 14 junio, sirviendo hasta el 16 de agosto de 1839, unos días antes de haber sido llamado a reemplazar a Pedro García de la Huerta, quien fuera el diputado propietario (titular) por Itata.
Se postuló a las elecciones parlamentarias de 1840, donde resultó electo diputado propietario por Puchacay, por el período 1840-1843. Fue vicepresidente de la Cámara, desde el 1 de diciembre de 1840 al 5 de julio de 1841; y presidente, desde el 5 de agosto al 5 de octubre de 1842. Integró la Comisión Permanente de Gobierno y Relaciones Exteriores.
En 1844, fue reelecto diputado propietario, esta vez por Curicó, por el período 1843-1846. Continuó integrando la Comisión Permanente de Gobierno y Relaciones Exteriores.
Fue nuevamente elegido diputado propietario, esta vez por Santiago, por el período 1846-1849. En este periodo ejerció como vicepresidente de la Cámara desde el 4 de agosto de 1848 hasta el 4 de junio de 1849.