John Rudolph Niernsee (Viena, 27 de mayo de 1814-Baltimore, 7 de junio de 1885) fue un arquitecto estadounidense. Se desempeñó como arquitecto principal del Ferrocarril de Baltimore y Ohio (B. & O.). Niernsee también contribuyó en gran medida al diseño y la construcción de la Casa del Estado de Carolina del Sur ubicada en la ciudad de Columbia, la capital de Carolina del Sur, y el Hospital Johns Hopkins de Baltimore. Junto con su socio, James Crawford Neilson, estableció el estándar para el diseño y la construcción profesional de proyectos de obras públicas en Baltimore y en diferentes estados de Estados Unidos. Muchas de sus obras están incluidas en el Registro Nacional de Lugares Históricos (NRHP)
Nació como Johann Rudolph Niernsee en Viena, ciudad capital del antiguo Imperio Austriaco y emigró a los Estados Unidos en 1837, a los 22 años.
Fue aprendiz de Benjamin Henry Latrobe, II, ingeniero y gerente de B. & O. y otros ferrocarriles (e hijo de otro conocido arquitecto, su padre Benjamin Henry Latrobe, 1764–1820). En 1847, con James Crawford Neilson, formó el estudio de arquitectura Niernsee & Neilson que sirvió en gran parte al Ferrocarril de Baltimore y Ohio (B. & O.).
Se le atribuye haber sido el mentor de Ephraim Francis Baldwin, otro conocido arquitecto de Maryland y Baltimore (y formó la firma Baldwin & Pennington, igualmente famosa a nivel local, con Josias Pennington), quien también diseñó edificios y estaciones para el Ferrocarril B. & O.
Durante la Guerra de Secesión fue comandante del Ejército de los Estados Confederados.
Murió en 1885 y fue enterrado en la Iglesia de San Pedro en Columbia.
Las obras de Niernsee o de la firma (con atribución) son:
Iglesia Grace Episcopal (más tarde llamada Iglesia de San Pedro y Gracia) Park Avenue y West Monument Street, 1850–52 diseñado con Nielsen
Catedral Episcopal Emmanuel en la calle Eager, 1857, diseñada con Nielsen
Capilla en la Cima de la Colina del Green Mount Cemetery, en Greenmount Avenue, Baltimore, que diseñó con Nielsen, es una obra neogótica.
El Hospital Johns Hopkins de Baltimore en 500 Broadway y el Johns Hopkins Colored Children Orphan Asylum.
1855-1856: la Iglesia San Juan Evangelista (por Niernsee & Neilson), Baltimore. Incluido en el NRHP en 1982.
1855: la Iglesia de San Pablo, 102 North Union Street, Petersburg (Niernsee & Neilson), incluida en el NRHP.
C. 1855, Villa Anneslie (mansión), 529 Dunkirk Road, Towson (Niernsee, John Rudolph), incluida en el NRHP.
1856-1865, estación Camden Street del ferrocarril de Baltimore y Ohio, 301 West Camden Street, Baltimore (Niernsee & Neilson)
1868: Aigburth Vale (mansión) en Towson (por Niernsee & Neilson), incluida en el Registro Nacional de Lugares Históricos (NRHP) en 1999.
1870: la Iglesia Presbiteriana de Churchville (torre del reloj de estilo italiano de Niernsee & Neilson), Churchville,ui inclda en el NRHP en 1986.
California. 1870: Clifton Mansion (renovación de la mansión anterior de Col. Henry Thompson ) para el nuevo propietario Johns Hopkins (1795-1873), en Clifton Park (por Niernsee & Neilson), incluida en el NRHP en 2007.