Joachim Eilers (Colonia, 2 de abril de 1990) es un deportista alemán que compite en ciclismo en la modalidad de pista, especialista en las pruebas de velocidad, keirin y contrarreloj.
Ganó nueve medallas en el Campeonato Mundial de Ciclismo en Pista entre los años 2013 y 2021, y doce medallas en el Campeonato Europeo de Ciclismo en Pista entre los años 2012 y 2021.
Participó en los Juegos Olímpicos de Río de Janeiro 2016, ocupando el cuarto lugar en la prueba de keirin y el quinto en velocidad individual y en velocidad por equipos.