Go-Sanjō Tennō (後三条天皇, Go-Sanjō Tennō?) (3 de septiembre de 1034 – 15 de junio de 1073) fue el 71.er emperador de Japón, según el orden tradicional de sucesión. Reinó entre 1068 y 1073. Antes de ser ascendido al Trono de Crisantemo, su nombre personal (imina) era Príncipe Imperial Takahito (尊仁親王, Takahito-shinnō?).
Go-Sanjō fue el segundo hijo del Go-Suzaku Tennō. Su madre fue la Emperatriz (Kōgō) Sadako (禎子内親王), tercera hija del Sanjō Tennō; sería el primer emperador en 170 años (desde el Emperador Uda) cuya madre no fue descendiente del clan Fujiwara.
Princesa Imperial Toshiko (聡子内親王) (1050 – 1131)
Príncipe Imperial Sadahito (貞仁親王, futuro Emperador Shirakawa) (1053 – 1129)
Princesa Imperial Toshiko (俊子内親王) (1056 – 1132), Higuchi saigū (樋口斎宮, Princesa Imperial sirviente del Gran Santuario de Ise)
Princesa Imperial Kako (佳子内親王) (1057 – 1130), Tomi-no-kōji Saiin (富小路斎院)
Princesa Imperial Tokuji (篤子内親王) (1060 – 1114). Emperatriz (Chūgū del Emperador Horikawa)
Príncipe Imperial Sanehito (実仁親王) (1071 – 1085), posible heredero del Emperador Shirakawa
Príncipe Imperial Sukehito (輔仁親王) (1073 – 1119)
Emperatriz (Chūgū): Keiko (馨子) (1029 – 1093), segunda hija del Emperador Go-Ichijō
Emperatriz Viuda: Fujiwara Shigeko (藤原茂子) (¿? – 1062), hija de Fujiwara no Kinnari (藤原公成), hija adoptiva de Fujiwara no Yoshinobu
Dama de la Corte: Minamoto no Motoko (源基子) (1047 – 1134), hija de Minamoto no Motohira
Dama de la Corte: Fujiwara no Akiko (藤原昭子), hija de Fujiwara no Yorimune
El Príncipe Imperial Takahito no fue descendiente del clan Fujiwara, por lo tanto el kanpaku Fujiwara no Yorimichi lo trató de manera negligente, pero el Emperador Go-Suzaku decretó tras la ascensión al trono de su hermano mayor (el Emperador Go-Reizei) que el Príncipe Imperial Takahito sería el heredero al trono.
Dado que el Emperador Go-Reizei no tuvo hijos propios hasta su muerte, el Príncipe Imperial Takahito se convertiría en emperador. Así en 1068, asume al trono a la edad de 34 años, con el nombre de Emperador Go-Sanjō.
El hermano menor de Yorimichi, Fujiwara no Norimichi asumió como kanpaku, pero el Emperador Go-Sanjō determinó gobernar personalmente. En 1069 decretó el Enkyū Shōen (el nombre Enkyū proviene del nombre de la era en que fue promulgado) y estableció una oficina gubernamental que certificara los registros de los Shōen. En 1070 reguló la seda y en 1072, en un intento de reformar el sistema Ritsuryō, planeó fortalecer las finanzas de la Casa Imperial.
En 1072, abdicó a los 38 años a favor de su hijo, el Emperador Shirakawa. El Emperador Go-Sanjō planeó establecer un gobierno enclaustrado, pero falleció por enfermedad al año siguiente.
Fue enterrado en las “Siete Tumbas Imperiales” en Ryōan-ji, Kioto. El túmulo dedicado al Emperador Go-Sanjō se conoce como Shu-zan; y la tumba fue hecha a través de una restauración de los sepulcros imperiales a finales del siglo XIX por el Emperador Meiji