Francisco Valles de Covarrubias, también conocido como Divino Valles (Covarrubias; 4 de octubre de 1524-Burgos; 20 de septiembre de 1592), fue un médico castellano, el mayor exponente español de la medicina renacentista. Considerado el creador de la anatomía patológica moderna. Médico de Cámara de Felipe II, y protomédico general de los Reinos y Señoríos de Castilla.
Francisco Valles nació en Covarrubias (un pueblo de la actual provincia de Burgos) y fue bautizado el 4 de octubre de 1524. Sus padres fueron Francisco Valles (también médico) y Brianda de Lemus. Tuvo tres hermanos: Pedro, que fue arcediano de Covarrubias; Fray Luis, religioso agustino; y Petronila, que fue esposa de Manuel Hurtado de Vera. En 1544 inició sus estudios en la Universidad de Alcalá en el Colegio de Trilingüe alcanzando en 1547 la licenciatura en artes y filosofía, convirtiéndose en 1553 en maestro en artes y filosofía. En 1553 se licencia en medicina, y se doctora en 1554; consta como profesor, al menos desde 1556, impartiendo clases de anatomía práctica mediante disecciones de cadáveres. En 1557 sucedió a Cristóbal de Vega en la cátedra de Prima de medicina en Alcalá hasta 1572.
Estuvo casado durante 42 años con Juana de Vera, con la que tuvo seis hijos: Lucía, Francisco, Juana, Catalina, Gabriel y Diego. En 1587 fundó un mayorazgo con su esposa, sobre la casa que tenía en la calle de Santiago y su hacienda en Alcalá de Henares.
Estudió en diversas ciudades europeas, lo que le hizo entrar en contacto con Andrea Vesalio, al cual sucederá en 1572 como médico personal de Felipe II, nombrándole «Médico de Cámara y Protomédico General de los Reinos y Señoríos de Castilla» el cargo médico más elevado de España, alcanzado gran prestigio profesional y reconocimiento como intelectual. Estableció el examen del "Protomedicato", que debían realizar en Madrid todos los licenciados en medicina para poder ejercer, como control de la formación recibida en las diferentes universidades de España. Fue este rey el que le calificó de "Divino", al curarle de una crisis gotosa.
Ejerció la mayor parte de su vida en Alcalá de Henares, donde enseñó medicina, siendo el primero que en Alcalá impartió clases prácticas con cadáveres, por lo que se le considera el creador de la anatomía patológica.
Además de médico fue un gran humanista y escritor, dominando con maestría el griego y el latín clásicos. Sus últimos años los pasó en la botica del Monasterio de El Escorial preparando la destilación de plantas naturales y organizando la biblioteca.
Habiendo hecho testamento el 29 de mayo de 1592, falleció el 20 de septiembre del mismo año en el Convento de los Agustinos de Burgos, al acompañar al rey Felipe II en un viaje. Sus restos, por su expreso deseo, fueron trasladados y enterrados en la Capilla del Colegio Mayor de San Ildefonso, en Alcalá de Henares. Debido al deterioro del lugar, el 22 de mayo de 1862, por iniciativa de personajes como el historiador Mariano González Sámano o el alcalde de Alcalá, Francisco Palou, se exhumaron los restos de Valles y se guardaron provisionalmente en una dependencia de la universidad hasta que volvieron a despositarlos en otro lugar de la iglesia. El 14 de abril de 2011, durante las obras de restauración de la capilla, se redescubrió la urna donde se encontraba desde el siglo xix.
Empezó a publicar desde muy joven, con 20 trabajos conocidos, desde traducciones de los clásicos hasta trabajos personales, tanto de tema médico como filosófico.
Controversiarium medicarum et philosophicarum (1556) (2ª ed. 1564) (3ª ed. 1583), exposición de cuestiones filosóficas que componen el saber médico.
Commentaria in quartum librum metheoron Aristotelis (1558).
Claudii Gal. Pergameni De Locis Patientibus Libri Sex (1559).
In Aphorismos, & libellum de alimento Hippocratis, comentaria (1561).
Octo librorum Aristotelis de physica doctrina versio recens & commentaria (1562).
Controuersiarum naturalium ad tyrones pars prima (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última). (1563).
Comentarii de vrinis, pulsibus & febribus (1565) (1569).
Commentaria in Prognosticorum Hippocratis (1567).
Galeni ars medicinalis commentariis (1567), sobre la traducción de las obras de Galeno.
Comentaria in libros Galeni de differentia febrium (1569), sobre la traducción de las obras de Galeno.