Florentino Ameghino es un municipio argentino de la provincia de Misiones, ubicado dentro del departamento San Javier.
Se halla a una latitud de 27°33′ S y a una longitud de 55°8′ O.
La localidad de Florentino Ameghino se encuentra a una distancia de 119 kilómetros de Posadas, la capital de la provincia. Posee una superficie de 107 km², tiene una población de 1979 habitantes y una densidad de población de 18,48 km² (Elaboración del IPEC sobre los resultados del censo del 2001).
Las Rutas de acceso al municipio son 2: la principal es la ruta pcial N.º 5 que se encuentra asfaltada. La otra posibilidad para acceder al municipio es a través de la ruta provincial 209 actualmente entoscada y buenas condiciones en la mayor parte de su tramo. Otras rutas provinciales que atraviesan al municipio son la 231 que une a Florentino Ameghino con la ruta costera, y la 215 que nace en Gdor López, pasa por el municipio y termina en Panambí.