Ernesto Jaen nació en Antón el 27 de noviembre de 1895. Estudió ingeniería civil en los Estados Unidos.[cita requerida] Trabajó en diferentes cargos. Fue ingeniero jefe de Obras Públicas, profesor de matemáticas, director de la Escuela de Artes y Oficios, Secretario de Higiene, Beneficencia y Fomento, Embajador en México y en los Estados Unidos.[cita requerida]
Arnulfo Arias Madrid fue depuesto el 9 de octubre de 1941 por un golpe de estado. El ministro de Gobierno y Justicia, Ricardo Adolfo de la Guardia, autor del golpe, lo justificó porque el presidente Arias había salido del país sin permiso de la Asamblea Nacional.[cita requerida]
Al ser derrocado Arnulfo Arias, le correspondía asumir la Presidencia a José Pezet, primer designado (vicepresidente), pero fue detenido y llevado a la Cárcel Modelo y en su calidad de segundo designado, Ernesto Jaén Guardia ocupó la presidencia durante algunas horas. Aceptó el cargo como un formulismo legal y seguidamente renunció para dar paso a que Ricardo Adolfo de la Guardia asumiera el mando. [cita requerida]
El tercer designado, Aníbal Ríos Delgado, nunca reclamó el cargo pues permaneció en Lima, Perú, por temor a ser detenido como otros seguidores de Arias Madrid. Apenas se consumó el golpe, fue sacado de la comandancia de la guardia Manuel Pino, y en su lugar se nombró a Rogelio Fábrega, quien había estudiado en la Escuela de Carabineros de Chile.[cita requerida] Era el segundo panameño graduado de milicia. [cita requerida]
Mientras transcurrieron las horas se nombró un nuevo gabinete en el que figuraba Ricardo Adolfo de la Guardia como ministro de Gobierno y Justicia, entonces los integrantes del Consejo de Gabinete se enfrascaron en un prolongado debate, que terminó con la determinación de hacer renunciar a Ernesto Jaén Guardia de la presidencia ante los miembros de la Corte Suprema de Justicia que le habían dado posesión unas horas antes.[cita requerida]
Después de presentar su renuncia, la primera magistratura recayó en el ministro de Gobierno y Justicia, Ricardo Adolfo de la Guardia.
De inmediato a Ernesto Jaén Guardia se le nombró embajador de Panamá en Washington.[¿por quién?]
Falleció en la Ciudad de Panamá, el 18 de abril de 1961 a los 65 años de edad.