Emílio Augusto Goeldi o Göldi (Emil August Goeldi) ( Ennetbühl, Saint-Gall, 28 de agosto de 1859 - Berna, 5 de julio de 1917) fue un médico, naturalista y zoólogo suizo-brasileño.
Estudió en la Universidad de Nápoles y luego se doctoró en la Universidad de Jena, en Alemania bajo la dirección del biólogo Ernst Haeckel. Invitado por el emperador Pedro II, arribó a Brasil en 1884 para trabajar en el Museo Nacional de Brasil en Río de Janeiro, en el que se desempeñó hasta 1890.
Laboró posteriormente en el Museo Paraense (que después se llamaría Museu Paraense Emílio Goeldi) en Belem, atendiendo la invitación del gobernador de Pará , Lauro Sodré; allí permaneció desde 1894 hasta 1907.
En 1908, fue nombrado profesor de Zoología de la Universidad de Berna.
En sus trabajos pioneros, Goeldi fue ayudado por varios otros investigadores, como el botánico suizo Jacques Huber (1867-1914), la zoóloga Emilia Snethlage (1868-1929), los geólogos Katzer y Kraatz, y Adolpho Ducke (1876-1959), etnógrafo y botánico.
Su trabajo fue muy amplio, pero se destacan sus estudios sobre los vertebrados y sobre los insectos parásitos o dañinos, como las filoxeras y además publica el libro American Vines en el que abogó por plantar los pies de las viñas americanas.
Entre sus obras se destacan As Aves do Brasil, publicada entre 1894 y 1900 y que fue completada por un atlas entre 1900 y 1906. Su obra sobre las aves de la Amazonia, Die Vogelwelt des Amazonensstromes, apareció en 1901.
Goeldi es muy reconocido como una figura médica en salud pública y en epidemiología de Brasil, debido a sus precoces estudios del mecanismo de transmisión de la fiebre amarilla y entendiendo la importancia de luchar con el mosquito vector de la enfermedad, varios años antes de que Oswaldo Cruz trabajara en ese tema.
Era el padre de Oswaldo Goeldi, un notable grabador e ilustrador brasileño.
e.a. Goeldi. 1886. Bericht über zwei ältere, unbekannt gebliebene illustrierte Manuskripte portugiesisch-brasilianischer Naturforscher. I. Die zoologischen Zeichnungen von Alexander Rodriguez Ferreira. II. Die zoologischen Zeichnungen von Arruda da Camara. Zoologische Jahrbücher, Jena, 2, 175-184
-------------. 1892. Zur Orientierung in der Spinnenfauna Brasiliens. Mitteilungen aus dem Osterlande (Neue Folge), 5, 200-248
-------------. 1897. A lenda amazônica do "cauré". Bol. Mus. Paraense, 2, 430-441
-------------. 1897. On the nesting of Cassicus persicus, Cassidrix oryzivora, Gymnomystax melanicterus and Todirostrum maculatum. Ibis, 7 (3), 361-370
-------------. 1898, 1897. A lenda amazônica do "cauré". Bol. Mus. Paraense, 2, 430-441
-------------. 1900. Sobre a nidificação do Cassicus persicus (japim), do Cassidix oryzivora (graúna), do Gymnomystax melanicterus (aritauá) e do Todirostrum maculatum (ferreirinho). Bol. Mus. Para. Hist. Nat. Ethnogr., (Mus. Para.) 3, 203-210
-------------. 1904. Against the destruction of white herons and red ibises on the lower Amazon, especially on the Island of Marajó. 2ª ed. Belém: Pará
-------------. 1905. Myrmecologische Mitteilung das Wachsen des Pilzgartens von Atta cephalotes betreffend. Art. presentado al C.r. 6th Congr. Int. Zool. Berna
-------------. 1905. Beobachtungen über die erste Anlage einer neuen Kolonie von Atta cephalotes. Art. presentado al C.r. 6th Congr. Int. Zool. Berna