Daniel Pudil (Praga, República Checa, 27 de septiembre de 1985) es un exfutbolista checo que jugaba de defensa.
Pudil empezó jugando en el FK Chmel Blšany. En 2004 fichó por el FC Slovan Liberec, equipo con el que debutó en la Gambrinus liga. Con este club consiguió su primer título de Liga en 2006.
En 2007 fichó por el Slavia Praga, con el cual se proclamó campeón de Liga en 2008.
En el mercado de invierno de 2012 fichó por el Granada CF de la Primera división de España, y lo cedieron hasta junio. A primeros de julio, justo antes de incorporarse a la pretemporada con el equipo granadino, lo decidieron volver a ceder hasta 2013 al Watford Football Club inglés.
Ha sido internacional con la selección de fútbol de la República Checa, ha jugado 35 partidos internacionales y ha anotado 2 goles.