Nikolaus Friedrich Stöhr (* 28. September 1706 in Kirchenlamitz; † 13. November 1766 in Wunsiedel) war ein deutscher Pädagoge und lutherischer Theologe.
Stöhr, Sohn eines Wundarztes, hatte schon in frühster Jugend eine Neigung für die Wissenschaften entwickelt. Nach dem Besuch der Schule seines Geburtsorts hatte er 1719 das Gymnasium zu Hof frequentiert und 1728 die Universität Jena bezogen, um ein Studium der philosophischen und theologischen Wissenschaften zu absolvieren. Dort waren Johann Franz Buddeus (1667–1729), Johann Georg Walch (1693–1775) und Johann Christoph Köcher (1699–1772) seine Hauptlehrer auf dem Gebiet des theologischen Wissens. Philosophie hörte er bei Johann Peter Reusch (1691–1758) und Johann Friedrich Wucherer (1682–1737), Johann Reinhard Rus und Leonard Hofmann (-1737) erweiterten seine Kenntnisse in den orientalischen Sprachen und deren Literatur.
1730 wechselte er an die Universität Halle, wo er besonders Joachim Justus Breithaupts, Joachim Langes, Johann Jakob Rambachs und Gotthilf August Franckes theologische Vorlesungen besuchte. Im Hebräischen und in den übrigen morgenländischen Dialekten unterwies ihn Christian Benedikt Michaelis, während er von Justus Henning Böhmer mit dem kanonischen Recht vertraut gemacht wurde. 1732 war er Lehrer am Pädagogium zu Halle und 1736 Konrektor in Saalfeld. 1740 ging er als Konrektor nach Hof und unterrichtete Mathematik, Logik, Geschichte und schöne Wissenschaften.
1749 ging Stöhr nach Bayreuth als Hofdiakon, Lehrer der an dem Markgräflichen Hof erzogenen Prinzessin Ernestine Auguste Sophie von Sachsen-Weimar und zugleich als Konrektor des dortigen Gymnasiums, sowie als Inspektor der Alumnen. Nachdem er hebräische und griechische Sprache auch noch Geschichte unterrichtet hatte, wurde er 1757 zum Professor der orientalischen Sprachen, der Geschichte und Theologie in Bayreuth ernannt, ging aber bereits 1758 als Superintendent, erster Prediger und Schulinspektor nach Wunsiedel.
Als Stöhr starb, hinterließ er den Ruhm eines vielseitig gebildeten Theologen und gründlichen Kenners der älteren, besonders der orientalischen, Sprachen. Außer mehreren lateinischen Programmen und Dissertationen schrieb er kein selbstständiges Werk von größerem Umfang. Aber auch aus jenen Abhandlungen, in denen er sich mit Gegenständen der Dogmatik, Pädagogik und Geschichte beschäftigte, sprach eine gründliche Gelehrsamkeit, gepaart mit seltenem Scharfsinn und regem Forschungsgeist. Sein anspruchsloser Sinn führte ihn in den Jahren 1742/1743 in einigen lateinischen Programmen zu einer gerechten Anerkennung und Würdigung der Verdienste Martin Luthers um die biblische Hermeneutik und Interpretation der heiligen Schrift. Mit vielem Scharfsinn erörterte er 1746 in einem lateinischen Programm die von Luther kurz vor seinem Tode aufgestellte Frage, ob ein gegenseitiges Wiedersehen der Seligen jenseits anzunehmen sei.
Standrede bei Beerdigung W. W. Hagen’s der Arzneikunde Beflissenen. Halle 1732
Diss. historica de scholis monasticis. Saalfeld 1737
Progr. I et II. An et quatenus scholae genio saeculi sint commodandae? Saalfeld 1738–1739
Progr. de minimo magnoque in regno coelorum, secundum Matth. 5, 19. Bayreuth (Curiae) 1740
Progr. Brevis comparatio inter ecclesiam Christi fundatam et renovatam. Bayreuth 1741
Progr. de meritis reformatoris nostri (Lutheri) in Hermeneuticam sacram. Bayreuth 1742
Progr. de meritis reformatoris nostri (Lutheri) in Hermeneuticam sacram et inprimis in interpretationem Scripturae sacrae realem. Bayreuth 174S
Progr. de eo, quod est novum et antiquum in regno coelorum, ad Matth. 13, 52. Bayreuth 1744
Progr. de Scriptura sacra perperam corruptionis insimulata. Bayreuth 1745
Diss. historico - philosophica de causis scholarum medio aevo in Germania collapsarum. Bayreuth 1746
Progr. de quaestione ab ipso Luthero pridie ante obitum proposita: Num aliquando beati in vita aeterna mutuo et distincte se agnituri sint? Bayreuth 1746
Progr. de regno coelorum sinapi assimilato, ad Matth. 13, 31. 32. Bayreuth 1747
Progr. de harmonia in tota re scholastica, fundamento, in quo unice scholarum salus nitatur. Bayreuth 1748