Johannes Scheibler (* 17. März 1628 in Dortmund; † 5. Oktober 1689 in Lennep) war ein deutscher evangelischer Geistlicher.
Johannes Scheibler wurde als Sohn von Christoph Scheibler und dessen Ehefrau erster Ehefrau Ursula (* 11. Juli 1588; † 20. Dezember 1632), Tochter des Kaufmanns Moritz Rossbecher aus Speyer. Sein Vater heiratete 1633 in zweiter Ehe Katharina (* 19. März 1585; † 18. April 1669), eine Tochter des Dortmunder Kaufmanns Johannes Nies und Witwe des Dr. jur. Freitag. Die zweite Ehe blieb kinderlos. Seine Geschwister waren:
Johann Christoph Scheibler (* 19. Januar 1612 (Taufe) in Gießen; † 17. Oktober 1660 in Lütgendortmund), ab 1639 Pfarrer in Lütgendortmund;
Peter Arnold Scheibler (* 16. Mai 1613 (Taufe) in Gießen; † 22. September 1687 in Dortmund), Pfarrer in Dortmund;
Katharina Elisabeth Scheibler (* 30. März 1615; † 11. Mai 1616);
Barbara Katharina Scheibler (* 13. Juni 1617 in Gießen; † unbekannt), verheiratet mit Prof. Johann Konrad Schragmüller (1605–1675), ab 1639 Rektor der Universität Marburg und ab 1639 Pastor in Speyer;
Johann Gottfried Scheibler (* 7. Juli 1619; † 19. Mai 1620);
Johann Hartmann Scheibler (* 23. April 1622; † 18. Mai 1633);
Anna Katharina Scheibler (* 26. Oktober 1624; † 23. August 1636);
Johann Melchior Scheibler (* 22. Juli 1631 in Dortmund; † 5. August 1631 ebenda).
Johannes Scheibler heiratete Katharina (* 9. Januar 1635 in Darmstadt; † 9. September 1704 in Burscheid), Tochter des Professor in Gießen und Superintendenten in Darmstadt Peter Haberkorn. Gemeinsam hatten sie dreizehn Kinder:
Peter Christoph Scheibler (* 13. Juli 1652 in Gießen; † 5. Dezember 1653 ebenda);
Hedwig Katharina Scheibler (* 31. März 1654 in Lennep; † 10. August 1657 ebenda);
Peter Christoph Scheibler (* 6. Mai 1656 in Lennep; † 3. November 1679 in Leipzig), studierte an der Universität Leipzig und verstarb als Magister auf dem Weg von Wittenberg nach Leipzig, als er dort die Stelle des Erziehers des jüngsten Prinzen August Leopold von Pfalz-Veldenz (1663–1689) antreten sollte, an Fleckfieber;
Justus (Jost) Arnold Scheibler (* 6. Februar 1658 in Lennep; † 24. August 1729 in Dortmund), Pastor in Dortmund, Superintendent seit 1722;
Christina Margareta Scheibler (* 13. Januar 1660 in Lennep; † 22. März 1737 ebenda), verheiratet mit Albert Veltgen (1654–1719), Pastor in Seelscheid und ab 1680 in Remscheid;
Barbara Katharina Scheibler (* 15. Juni 1662 in Lennep; † 17. Juni 1662 (Begräbnis) ebenda);
Hedwig Barbara Scheibler (* 15. Juni 1662 in Lennep; † 5. April 1691 (Begräbnis) in Dortmund); verheiratet mit Johann Beurhaus (1655–1704), Prediger an St. Petri in Dortmund;