Johann Michael Klein (* 1692 in Ottobeuren; † 17. Dezember 1767 ebenda) war ein deutscher Zimmermeister. Er schuf 1753 den Dachstuhl der Basilika St. Alexander und Theodor im oberschwäbischen Ottobeuren. Der Dachstuhl gehört zu den großen Meisterwerken der barocken Zimmermannskunst und wird noch heute für Studien benutzt.
Klein hinterließ eine Inschriftentafel:
Hermann Haisch (Hrsg.): Landkreis Unterallgäu. Memminger Zeitung Verlagsdruckerei GmbH, Memmingen 1987, ISBN 3-9800649-2-1, S. 836.
Aegidius Kolb: Ottobeuren. Schicksal einer schwäbischen Reichsabtei. Kempten 1986, S. 254.
Schnell und Steiner (Hrsg.): Ottobeuren, Kloster und Kirche. Schnell & Steiner, 1979, S. 24.